东京大学设立的学系主要有：法学部、医学部、工学部、文学部、理学部、农学部、经济学部、教养学部、教育学部。研究生学系主要包括：人文社会系研究科、理学系研究科、数理科学研究科、教育学研究科、工学系研究科、新领域创成科学研究科、法学政治学研究科、农学生命科学研究科、情报理工学系研究科、经济学研究科、医学系研究情报学科、情报学环学际情报学府、综合文化研究科、药学系研究科、公共政策大学院。

材料补充：
东京大学的专业主要有：

法学部：私法、公法、政治。

医学部：医学科、健康综合科。

工学部：社会基础学科、都市工学科、机械情报工学科精密工学科、电气电子工学科、计数工学科、应用化学科、化学生命工学科、建筑学科、机械工学科航空宇宙工学科、电子情报工学科、物理工学科、材料工学科、化学系统工学科、系统创成学科。

文学部：思想文化学科、言语文化学科、历史文化学科、行动文化学科。

理学部：数学科、物理学科、地球行星学科、化学科、生物学科、情报科学科、天文学科、地球环境学科、生物化学科、生物情报科学科。

农学部：应用生命科学课程、兽医学课程、环境资源学课程。

经济学部：经济学科、金融学科、经管学科。

教养学部：超域文化科学科、综合社会科学科、广域科学科、地域文化研究学科、基础科学科、生命・认知科学科。

教育学部：综合教育科学科。

药学部：药学科。